移植完后，胚胎就像一颗种子一样在妈妈子宫里茁壮成长，然而并不是所有人胚胎移植都是一帆风顺的，免不了有一些人会在胚胎移阶段屡屡遭遇挫折。在试管助孕过程中，若患者年龄小于40岁，累计移植优质胚胎数大于10枚或移植次数超过3次仍未妊娠，一般可视为反复着床失败。胚胎着床失败的原因可归纳为下列几种：
(一)子宫内膜容受性下降：
(1)子宫构造异常，如：子宫先天发育畸形(双角子宫、子宫纵膈)、子宫内膜息肉、子宫内膜炎和子宫粘膜下肌瘤。
(2)子宫内膜薄或子宫血液循环不好。
(3)子宫腔持续积水：输卵管内的积水往子宫腔返流之故。持续性的子宫腔积水会造成胚胎着床失败及胚胎停育。
(4)子宫内膜分泌的各种蛋白及细胞因子过多或过少，都会影响胚胎的着床。
(二)移植的胚胎本身有缺陷：
(1)染色体的异常或基因异常会影响胚胎的发育，致使胚胎到某一阶段就停止发育。很多植入子宫内的胚胎着床失败均是因为胚胎本身染色体异常所致。这些染色体异常的胚胎有时外表看起来细胞形态大小均正常、细胞分裂速度也正常且在胚胎分级上是属于一级或二级的优质胚胎。另外手术患者年龄越大，卵子老化，易发生染色体不分离，导致胚胎染色体异常。
(2)透明带异常，包围卵子的透明带，在卵子受精前和胚胎孵化着床前是用来保护卵子和胚胎。如果胚胎在体外培养过久，透明带会变厚及变硬;年纪大的妇女所排出的卵子其透明带也较厚。透明带太厚或太硬都有可能会引起胚胎着床失败。
